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生命の起源 #938 : LIFE Mailinglist Archive for the Origins of Life study
LIFE Mailinglist Archive for the Origins of Life Study

ID
938
DATE
11/25/1998 03:00:53 PM
TITLE
[life:00938] Re: Genome and Ogigin (
AUTHOR
Kazuhiro Iida <iida@***.***>
BODY


荒様 LIFEの皆様

おもしろい情報ありがとうございます.

> http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/

これは,原核細胞生物でゲノムのわかっているものの
クラスター分析をした結果が載ってます.距離基準
については勉強の必要があるのですが,orthologus
(同義な?と訳すのかな)な少数のクラスタがとれて
くるそうで,荒さんご紹介の渡辺さんのお話につながる
ものですね.渡辺さんの話はおもしろいので別メール
で考えてみたいと思います.
(遺伝子の種類は1000個以下っていう例の話にも関係
するのかな)

> http://wit.mcs.anl.gov/WIT2/wit.html

これは,遺伝子配列からその遺伝子が関与する代謝系
の経路を推定するというプロジェクトのホームページ
でした.代謝経路データベースとか類似配列のデータ
ベースとかいろんな情報つかって,まだ決定されてい
ないが必要なので,そのゲノムに含まれるだろう酵素
まで推定してくれる,おもしろいソフトが紹介されて
ます.(素粒子の研究している米アルゴンヌ国立研究所
のプロジェクト)


(つづく)

飯田
--
Kazuhiro Iida, "Life and Evolution '98 --> "
Fundamental Research Laboratories, NEC Corporation,
34 Miyuki-ga-Oka, Tsukuba, Ibaraki, 305-8501 Japan.
Phone +81(298)50-1142, Facsimile +81(298)56-6136.
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