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荒様 前田様 ＬＩＦＥの皆様
ゲノム配列の決定は，予想を上回るピッチですすんでいるようです．
で，これらの配列情報から「生命の起原に関して」どんな情報が引き
出せるでしょうか？
私もふくめて，あまりに膨大な宝を目の前にして，どこから使って
良いかわからない状態の人多いんじゃないでしょうか？
特定の蛋白質の配列から系統樹が描けることはよく知られて
いますよね．全配列からも描けるのかしら？なんて，とんでも
ないこと考えてしまいます．
全体を見渡して，遺伝子の進化規則みたいなものがでてくるん
でしょうか？
それとも，個別の生物の特定の遺伝子が，生命の起原に不可欠
だったことがわかったりするでしょうか？ んー．
井戸端会議で漠然としたアイデアをまとめてみたいです．
ご協力お願いします．
飯田
Takeshi Ara wrote:
>
> 荒＠京大農です。
>
> >前田＠生物研です。
> >不勉強で申し訳ありませんが、今全ゲノムが同定された生物って
> >何と何なんでしょう？
>
> http://bsw3.aist-nara.ac.jp/GTC/mori/research/gmend.html
>
> にのせています。これ以外に企業が決めているけど公表しない物とかはあるようです。
> お金を出せば情報を買えるようですが、一般に研究者として利用できるのはこれらの
> 配列情報です。
>
> Archaeoglobus fulgidus VC-16,DSM4304
> Methanobacterium thermoautotrophicum delta H
> Methanococcus jannaschii DM52661
> Pyrococcus horikoshii OT3
> Aquifex aeolicus
> Bacillus subtilis 枯草菌
> Borrelia burgdorferi
> Campylobacter jejuni NCTC11168
> Chlamydia trachomatis クラミジア
> Escherichia coli K12 大腸菌
> Haemophilus influenzae Rd KW20 インフルエンザ
> Helicobacter pylori 26695 ピロリ菌（胃潰瘍）
> Mycobacterium tuberculosis 結核菌
> Mycoplasma genitalium G37 マイコプラズマ
> Mycoplasma pnuemoniae マイコプラズマ
> Rickettsia prowazekii リッケチア
> Synechocystis sp. PCC6803 ラン藻
> Treponema pallidum
> Saccharomyces cerevisiae 出芽酵母
>
> 株が違えば配列も違う、ということで大腸菌ではO157の配列も進行中です。
> もう少し詳しく言うと、アメリカのプロジェクトの株と日本のプロジェクト
> の株では違いがあり、K12ではMG1655(アメリカ,終了)とW3110（日本，
> 進行中）があります。クラミジアもいくつかの株でプロジェクトが進行中
> のようです。
>
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> 荒 武 (Takeshi Ara)
> 京都大学 農学研究科 農芸化学専攻 植物栄養学研究室
> Tel : 075-753-6108 FAX: 075-753-6128
> e-Mail : ara@***.***
> --------------------------------------------
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Kazuhiro Iida, "Life and Evolution '98 --> "
Fundamental Research Laboratories, NEC Corporation,
34 Miyuki-ga-Oka, Tsukuba, Ibaraki, 305-8501 Japan.
Phone +81(298)50-1142, Facsimile +81(298)56-6136.
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