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木賀様 ＬＩＦＥの皆様
こんにちは，
飯田：（それからええと，：）マーカーを設計するというのが良く分からないので
教えて下さい．）
木賀さん：説明不足ですいません。
RNAでも、大腸菌でも、いろいろな遺伝型をもつプールの中から「当たり」を単離
するために何らかの指標が必要です。今回の場合は、マーカーとして、コドンの割り
当てが変化することが菌の生育に有利になるための仕掛けをイメージしてください。
例としては、天然にも存在する、ｓｔｏｐコドンにアミノ酸を割り当てる例があり
ます。ｓｔｏｐコドンに対応するtRNA（サプレッサーtRNA）を準備します。tRNAの種
類によっては、アンチコドンをｓｔｏｐコドンに対応するように変化させても、アミ
ノアシルtRNA合成酵素（ARS）はそのtRNAを認識してアミノ酸を結合します。
ここで、生育に必須な遺伝子にｓｔｏｐコドンが入る点突然変異を入れた菌を準備
した場合、この菌は適切なサプレッサーtRNAを供給されないと生き残れません。この
しかけで、ｓｔｏｐコドンにアミノ酸を割り当てるためのtRNAをセレクションするこ
とができます。
飯田：ええとようするに，
・マーカ− ＝ 菌の生育に必須な遺伝子
・初期処理 マーカーの途中に UGAとかSTOPコードを入れておく，たぶん，
遺伝子相同組み替えでやるんでしょうね．
・サプレッサーtRNA ＝ STOPコドンに対応するアンチコドンを持つにもかかわらず，
ARSが作用してSTOPが入った部分のアミノ酸がくっついてし
まうもの．
・サプレッサーtRNAの選択？ 菌のtRNAの遺伝子に突然変異を起こしまくって生き残って
いる菌を釣ってくる．
といった感じの実験ですね？
飯田：
ミトコンを考えますと，あれの中身って，通常の細胞質と異なる化学組成
中略，．．．
られませんでしょうか？つまり，例えば，ｐＨ（単なる思いつき）を変
えることで，コードも揺らぐということはないでしょうか？
木賀：面白い考えです。ｐＨ依存性の実験をさせていただくかも知れません。
飯田：素人の単なる思いつきなので，ちゃんと調べてからにして下さいね．
以下どうもありがとうございます．
木賀さん：ARSの水平移動に関しては、
Shiba et al. , Trends in Biochemical Science vol.22, pp 453-457
に良い総説があります。
飯田＠ＮＥＣ
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"Life and Evolution '98"
Kazuhiro Iida,
Fundamental Research Laboratories, NEC Corporation,
34 Miyuki-ga-Oka, Tsukuba, Ibaraki, 305-8501 Japan.
TEL +81(298)50-1142, FAX +81(298)56-6136.
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