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生命の起源 #1727 : LIFE Mailinglist Archive for the Origins of Life study
LIFE Mailinglist Archive for the Origins of Life Study

ID
1727
DATE
05/22/2006 12:16:07 AM
TITLE
[life:001727] Re: 化学構造データベース
AUTHOR
FUTAMURA Yasuhiro <futamura@***.***>
BODY


飯田様 LIFEの皆様

国立国際医療センターの二村(ふたむら)です。

飯田様がお尋ねの「化学構造検索のアルゴリズム」の件、
以下の本が参考になるかもしれません。

J. Gasteiger & T. Engel編、船津公人監訳
ケモインフォマティクス 予測と設計のための化学情報
丸善-Willey(2005)
ISBN 4-621-07552-7
18,000円+税

特に、
第2章 化合物の表現
2.3 線形表記
2.4 組成のコード化
2.5 構造情報の処理
第6章 化学構造検索
6.2 完全構造検索
6.3 部分構造検索
6.4 類似検索
辺りが参考になるのでは、と思います。
章末の参考文献も充実しています。

国立国際医療センター研究所/国立感染症研究所
二村泰弘
futamura@***.***

Origin wrote:
> LIFEの皆様
>
> 質問とお願いです.化学系,情処系の方よろしくお願いいたします.
>
> 1.化学構造の検索
>
> 化学物質の構造を比較したり,部分構造で検索できる
> データベースソフトが多数あるそうですね.
> 使ってる方,おられませんか?どんなふうに使うのでしょうか?
>
>
> 2.構造検索するフリーソフト,あるいはアルゴリズム
>
> 上記のデータベースは,化学物質の構造をグラフで記述しており,
> 部分グラフの一致,不一致で検索しているらしいのですが,
> 具体的アルゴリズムについて情報を持っておられる方,おられませんか?
> ご指導の程よろしくお願いいたします.
>
> 飯田一浩

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