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横林様
おひさしぶりです。お元気ですか？
> 耳にされた事はあるかもしれませんが、最近Synthetic Biologyという
→ 木賀さんの守備領域に重なりますね。
横林さん：
> プログラム、つまりソフトウェアはDNA以外にありえないと思います。
> 酵素はあくまでDNAに書かれたプログラムの実行結果です。さらに生物の
> 特徴はハードウェアが基本的にすべてソフトに記述されているという点
> です。コンピュータウイルスがあるように生物にも細胞のOSを乗っ取る
> ウイルスが発生するというのも面白いアナロジーです。
飯田：
横林さんは、たぶんコンピュータ全体を細胞になぞらえて
ソフトウェア ＝（イコール） ＤＮＡ説なんですよね。（＾＾）
私は、その立場でもソフトウェアに相当するのは酵素かなあ。
ソフトウェア ＝ （変換の）因果関係 ＝ 酵素 説。（＾−＾）
細胞では酵素が、酵素自体が担っている因果関係に基づいて
物質を変換している。この情報は、なにしろ、すぐに使えるわけです。
これに対して、DNAはすぐに使えない配列情報（暗号）だけ保持している。
酵素に翻訳されて初めて、使える情報になるわけです。
メモリ上のソフトウェアもＨＤＤ上のソフトウェアも、すぐに使える、直接的な
因果関係を保持しています。
暗号化あるいは圧縮されたファイル（拡張子が、tar とか zip とか）も同じです
ね。
そういう意味で、「コンピュータで」ＤＮＡに相当するのは何と言いますか
レジストリかなと思うわけです。
レジストリは、自分が直接的にＩ/Oの監視をしたり、計算したりはまーたく
しません。単にシステムの構成と、どういう時にどういう、ソフトウェアが
はたらくべきかだけ保持していて、ＯＳの実行手順部分とソフトウェアから
参照されています。
windowsで新しいソフトをインストールする時、すぐ使えるプログラムの
部分だけでなく、レジストリにソフトウェアがどのフォルダにあるかとか、
このソフトウェアはドライバソフトであるから、装置がつながれた時に
起動するんだよ、とかいう情報も、同時に書き込まれます。
これ（新しいソフトウェアのレジストリ）こそ、ウイルスっぽくないですか？ （＾
−＾）
もちろん、ＤＮＡの役割の全てが レジストリの機能にみつかるかというと、
そんなことはありませんが、比喩という意味です。
ただ、レジストリは特殊な情報を担っていて、ＤＮＡとＤＮＡに関連する
細胞の機構の中に、レジストリに相当する仕組み、あるいはまだ気付かれて
いない機能が隠されているかもしれない、なーんて、思ったりして。
横林さん：
> 自己複製、自己修復、進化など工学が生物から得てきたヒントは多々あ
> りますが、今、生物を工学的な視点や手法で見つめなおし、engineerし
> ようという流れが起こっているのは興味深いと思っています。
飯田：
ウエブサイト訪問しました。
合成（Synthesis）方向の生物学と、分析（Analysis）方向の生物学が、
ともに情報を共有しながら進むといいなあと思いました。
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