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荒様 飯田様
Takeshi Ara-san wrote:
>>長いのを使えば１ＧＢは行きますよ。まあ，１分子の情報量は数が増えればほどんど誤差
>>で，ＤＮＡコンピュータと同様，やはり数の強みでしょう。千個使うと１ＴＢ，アボガドロ
>>数程度使えば，しばらくは困らないです。
>
>種類が違うものの選別機構は、細胞内だと数万から数十万種類の高分子のラベルが限界
>のような気がしますが（免疫系とか）、、、もちろんこれらの組み合わせ選別にすればかなり
>膨大な種類を選別できますけど。これもまあ読取装置の問題ですが。でもアボガドロ数種類
>の選別機構は不可能な気がしますが・・・そもそも担当するであろう人間の管理範囲限界
>を超えているのではないかと（私はそのバックアップ管理担当者にはなりたくないです・・・）。
>管理情報自体をDNAにすればいいのですかね？（これは読取装置そのものの構造的な階層
>性が要求されるということなのでしょうか? 細胞のように。）
管理情報自体をDNAにして，読み取り機構を細胞にすると，生物に近いものになりますね。情報（ID
の他，自己複製等々，飯田さんが列挙した生命の属性）をより効率的に維持できるように自己修復
や機能向上の機能も追加すると，ますます生物に近づきそうです。
>>今の所，１つのDNAのデータを読み出すたびにヒトゲノムプロジェクトやイネゲノムプロ
>>ジェクトを立ち上げなければならないので大変ですが，今日のニュースで日立のDNA検出用
>>RFIDセンサチップ
>>http://nikkeibp.jp/wcs/leaf/CID/onair/jp/elec/358960
>>の話がありましたねえ。こういう方式でやると，意外と実現するの早いかも知れません。
>>もっとも半永久的保存が重要なので，当面，読み出し機構はヒトゲノムプロジェクトでもＯ
>>Ｋのような気がします。
>
>5年後、10年後の科学技術は読めませんが、10年たっても最終的なヒトゲノム配列はまだ
>決定していないと思います（もちろん精度はかなり上がっていると思いますが）。まあ読めな
>いうちは全体に対しては書き込めないと思います（一部に情報を書き込むというのは遺伝子
>治療レベルでできるにしても）。
>
>それと、同じDNA配列でも修飾や他の分子との相互作用で3次元立体構造が違うと「意味」
>が違ってきますけど、10年後にはそれもだいぶわかってきているのでしょうかね？そうすると
>短くてももっと情報を詰め込めるようになるかもしれません（よい読取装置さえあれば）。
>
>PS
>なんにしても読み取りコストが早く１００?１０００分１くらいになってほしいものです。
>（＞日々ヒトゲノムと格闘している現場として）
>でもそうするとデータの量も１００?１０００倍になるのですよね。結果として。そうすると解析
>するコンピューターも同じだけ早くなってもらわないと困るんですよね・・・（忙しさは変わらな
い?）
数年前のNatureに，DNAにはあの有名な２重らせん構造以外に，ヌクレオチドが内側に来て外側に塩
基が来る構造もあるというレポートがありました。この状態にするには「強く引っ張るだけで良
い」とかで，DNAを超高速で読み取れるなあ，と思いました。まだどこのメーカもやってないですね
（大げさなナノテクを使わなくてもローテクで出来そうな気がするのですが）。
うちの場合，まずは目先のストレージの問題が脅威で，PC雑誌を見ていたら，ストレージはネット
系エンジニアの最近の最大の悩みとか。ブログの次のライフログでは１人あたり11TB使うそうで，
「11TBまでフリー」のサイト作るの大変です。
ホリエモンはTV出たりして結構暇そうですが，何で研究者って常に忙しいんでしょうね。
Masayuki HIRAFUJI, Ph.D. (hirafuji@***.***)
Computational Modeling Lab.
NARC Tsukuba 305-8666 Japan
Phone:+81-29-838-7177 FAX:+81-29-838-8551
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