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飯田 様、 平藤 様
荒です
>イモの育種の中谷さんが「うちの研究室では1600種類のイモの遺伝資源を保存している」と
>のことで，しかも保存したいのは「ＤＮＡそのものではなく形質」だそうで，「毎年，所定
>の形質を持つイモを選抜して維持している」そうです。冗長性の高いDRAM型DNAメモリ（形
>質）のリフレッシュを人間という共生生物がやっていることになります。
こういう仕事は大変で、もちろんうっかり人が間違えて置いたりすると分離はおおごととか。
と、いうか、こうしたストックセンター（ＤＮＡストックセンター）も含めて、取り寄せたら正しいも
のかどうか各自実験してチェックしてから使いますけど、１０−３０％くらいは間違って送られて
くるという話です。
でも実際の細胞内でもたくさんの間違い合成分子があるということらしく、それを一生懸命
取り除く機構があって、それがまあまあがんばれていれば無事生きていられるという話ら
しいです。「間違い不要物を的確に除く」＝「エラー校正」機構が大事だということでしょうねか
（読取装置の問題）。
>長いのを使えば１ＧＢは行きますよ。まあ，１分子の情報量は数が増えればほどんど誤差
>で，ＤＮＡコンピュータと同様，やはり数の強みでしょう。千個使うと１ＴＢ，アボガドロ
>数程度使えば，しばらくは困らないです。
種類が違うものの選別機構は、細胞内だと数万から数十万種類の高分子のラベルが限界
のような気がしますが（免疫系とか）、、、もちろんこれらの組み合わせ選別にすればかなり
膨大な種類を選別できますけど。これもまあ読取装置の問題ですが。でもアボガドロ数種類
の選別機構は不可能な気がしますが・・・そもそも担当するであろう人間の管理範囲限界
を超えているのではないかと（私はそのバックアップ管理担当者にはなりたくないです・・・）。
管理情報自体をDNAにすればいいのですかね？（これは読取装置そのものの構造的な階層
性が要求されるということなのでしょうか? 細胞のように。）
>今の所，１つのDNAのデータを読み出すたびにヒトゲノムプロジェクトやイネゲノムプロ
>ジェクトを立ち上げなければならないので大変ですが，今日のニュースで日立のDNA検出用
>RFIDセンサチップ
>http://nikkeibp.jp/wcs/leaf/CID/onair/jp/elec/358960
>の話がありましたねえ。こういう方式でやると，意外と実現するの早いかも知れません。
>もっとも半永久的保存が重要なので，当面，読み出し機構はヒトゲノムプロジェクトでもＯ
>Ｋのような気がします。
5年後、10年後の科学技術は読めませんが、10年たっても最終的なヒトゲノム配列はまだ
決定していないと思います（もちろん精度はかなり上がっていると思いますが）。まあ読めな
いうちは全体に対しては書き込めないと思います（一部に情報を書き込むというのは遺伝子
治療レベルでできるにしても）。
それと、同じDNA配列でも修飾や他の分子との相互作用で3次元立体構造が違うと「意味」
が違ってきますけど、10年後にはそれもだいぶわかってきているのでしょうかね？そうすると
短くてももっと情報を詰め込めるようになるかもしれません（よい読取装置さえあれば）。
PS
なんにしても読み取りコストが早く１００?１０００分１くらいになってほしいものです。
（＞日々ヒトゲノムと格闘している現場として）
でもそうするとデータの量も１００?１０００倍になるのですよね。結果として。そうすると解析
するコンピューターも同じだけ早くなってもらわないと困るんですよね・・・（忙しさは変わらない?）
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荒 武
TAGC, INSERM
takeshi@***.***
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