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荒様 ＬＩＦＥの皆様
>飯田： >ゲノムプロジェクトに続いてプロテオーム（Proteome）プロジェクト
> >というのが始まるとかの噂がありま．
↑（気づかないうちに大阪弁になっていま
した．）
荒さん：> PROTEINE+GENOME=PROTEOME
>
> といわれてます。ある生物の全ゲノム配列がわかり、全遺伝子の予測はついた。
> しかしそれらの機能はまだ半分近く未知であり、その機能を解明していこう、
> というものです。
飯田：つまり，蛋白質機能→遺伝子配列というこれまでの方法論でなく．
遺伝子配列→蛋白質機能という，逆むきの研究戦略を取るわけですね．
遺伝子配列をどう使うのでしょうか？
蛋白質を合成して，生化学機能を調べるのは，スプライシングとか
全ての機能について調べるわけには行かないとか
色々問題があるので，生体内のmRNAをつり上げて来て，そのcDNA
を作っておいて，合成するようなことになるのかな．
（ゲノムプロジェクトではじめ，日本はcDNAに注目して研究していた
そうですが，その成果との関係は？？？？？）
> 飯田：>ですが，プロテオームプロジェクトで例えば，蛋白質の形（構造）
> >の祖先形みたいのもわかるのでしょうか？
>
荒さん：> そういう研究もなされていると聞きました。祖先形というか、基本構
造ユニット
> の種々の生物ゲノム上での分布とかを見ていくと、なにか見えてくるかも知れま
> せん。ここらへんはわりと計算機屋の分野です。去年の分子生物学会でいくつか
> 発表がありましたが、まだ配列的な話で形まではまだ話がいたっていません。
飯田：以前，確率論理モデルをつかって蛋白質のモチーフ抽出をしたことがあり
ます．
このモチーフどんな形になるのかなとか，配列違っても，同じ形なら同じ機能
が出るのかなとか，面白がっていました．重要なのは立体構造ですね．
計算器で自由エネルギーとか計算した結果は，まだ精度が良くないですよね．
となると，Ｘ線結晶構造解析が，ゲノムプロジェクトの配列解読技術に相当
する中心的技術になるんでしょか？？？？？
いずれにせよ，蛋白質の構造（形）の進化とか分かると凄く面白いです．
飯田＠ＮＥＣ
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"Life and Evolution '98"
Kazuhiro Iida,
Fundamental Research Laboratories, NEC Corporation,
34 Miyuki-ga-Oka, Tsukuba, Ibaraki, 305-8501 Japan.
TEL +81(298)50-1142, FAX +81(298)56-6136.
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