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用事が多くて，好きな研究おあずけを食っている飯田＠ＮＥＣです．
今日は，文献紹介を一ついたします．
{Riddle, D.S. et al. (1997) ``Functional rapidly folding proteins from
simplified amino acids sequences," Nature structural biology
4:805-809.}
生命の起原を考える時，こうした疑問をもたれた方はおられないでしょうか？
今ある生体の蛋白質は，２０種類ものアミノ酸が複雑な配列を成しているが，最
初
からそんなに複雑な蛋白質ができたとは考えにくい．では，特定の機能を保った
まま
どれだけ配列を簡単にできるだろうか？
また，今の生体の蛋白質は，とても効率良く折り畳まれて機能のある立体構造を
作っていると聞くが，最初からそういう効率の良い折り畳みができたとは考えに
くい．
だとすると，蛋白質の折り畳みは，進化によって獲得されたのか？
上の論文は，こうした疑問に幾分，定量的な答えをだしています．
彼らの結論から言いますと，
１．少なくとも特定の物質を見分けて結合できる立体構造を取るには，最低５種
類の
アミノ酸があれば良く，逆に３種類のアミノ酸では，そうした機能構造はとれな
い．
２．蛋白質の折り畳みは，配列が簡単でも，現在の複雑な蛋白質とほぼ，同じ
スピードで折り畳まれる．蛋白質の折り畳みの速さは，配列に刻まれた進化
の記録や，シャペロニンなどとの相互作用というよりは，もともと，
自由エネルギー地形に従って，迅速におりたたまれる性質があると言える．
というものです．
実験の概要は，
βシート構造を持ち，特定のペプチドに結合する性質がある，src SH3という蛋
白質
ドメインの遺伝子を，少ないアミノ酸の種類に変えたバリアントをファージディ
スプ
レイ系で発現させ，例のペプチドへの結合をもって，選択した．得られた蛋白質
の
性質を，結合定数，ＮＭＲスペクトル，circular dicroism(円??），などなどの
諸元に関して，元の蛋白質と比較した．というもの．
とすると，最初の酵素って結構簡単にできたのかもしれませんね．
飯田＠ＮＥＣ
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"Life and Evolution '97"
Kazuhiro Iida,
Fundamental Research Laboratories, NEC Corporation,
34 Miyuki-ga-Oka, Tsukuba, Ibaraki, 305-8501 Japan.
TEL +81(298)50-1142, FAX +81(298)56-6136.
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