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高橋 様 ＬＩＦＥの皆様
高橋さん：
E-Cellでは現在採用している標準的な積分間隔の10^-3sに関して
これらは妥当な仮定であるというのがたてまえというか仮説です。
# 主な酵素のKcat(catalytic constant)の値からの推論です
飯田：
釈迦に説法という感じがありますが，自然現象のシミュレーションの
場合，時間ステップは，短ければ良い，あるいは長ければ良いと
いうものではありません．問題にしている現象に合わせて選ぶのが
一番です．例えば，fsec オーダーの時間ステップで化学反応を
を追うとすると，これは分子の形がどう変形するかといったミクロ
な現象を追うことに適していますが，濃度レベルのマクロな反応を
追うのには短すぎます．計算量が多いというだけでなく，平衡が成
り立たないからです．
Kcatから 1ms を導かれた根拠をお教えいただけると，もう少し
具体的にお答えができるかと思います． ：）
風邪お大事に．
（つづく）
飯田＠ＮＥＣ
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"Life and Evolution '97"
Kazuhiro Iida,
Fundamental Research Laboratories, NEC Corporation,
34 Miyuki-ga-Oka, Tsukuba, Ibaraki, 305 Japan.
TEL +81(298)50-1142, FAX +81(298)56-6136.
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