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高橋 様 ＬＩＦＥの皆様
正月をはさんでしまいましたので，ちょっと
復習いたします．
Genome Infrmatics の E-Cellの論文を読ませていただいて
凄いと思ったのと同時に，ちょっと疑問に感じたのは，
全ての反応がミハエリスメンテン式に則って計算されている
ことでした．同式は，平衡状態
（順方向反応の速度と逆反応の速度が同じ．）を仮定して
います．
この仮定が明らかに妥当でない反応，例えば，
ＡＴＰが関与するような反応，膜を介した反応などが細胞
内には存在します．こうした反応系もまた，扱うには
非平衡統計もしくは，Bray先生のところでやっているような
よりミクロなレベルでの確率的シミュレーションが必要に
なります．（その後，Bray先生のシミュレーションも，
ＡＴＰなどの関与しないsteady stateしか扱っていない
ことがわかりました．）
もちろん，分子レベルまでミクロにシミュレーションする
分子動力学的方法もありますが，それでは，E-cellが意図
するような長時間にわたる現象を追うことはできません．
計算量的に不可能です．
そこで非平衡状態にある反応系を扱う方法として非平衡
熱力学あるいは，非平衡統計熱力学を考慮する価値がでてくる
と思うわけです．
飯田一浩
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"Life and Evolution '97"
Kazuhiro Iida,
Fundamental Research Laboratories, NEC Corporation,
34 Miyuki-ga-Oka, Tsukuba, Ibaraki, 305 Japan.
TEL +81(298)50-1142, FAX +81(298)56-6136.
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