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高橋 様 小野 様 荒様 ＬＩＦＥの皆様
昨日のＶゴールは凄かったですね！
夜更かししてしまいレスが遅くなりました． ：）
> 規模が大きくなってきてこころぼそくなってきたので、
> 計算機が十分速くなるまでは地域に一つ程度のcomputing centerにおかれた
> ECELL serverに専用クライアントで接続する、というシステム設計も
> 視野にはいってきました。
確か，港区に本社のある何とかいうコンピュータ会社で
Cenjuという超並列マシンが公開されています．
申請すると使えるはずです．
http://www.hpc.uh.edu/cenju/Welcome.html
> > ２．計算量というよりも問題は，
> > １）何が目的で，何を見るか
> > ２）自然現象とのすりあわせが必要かどうか
> > ３）必要ならば，それが可能かどうか
> > ではないでしょうか？
> >
> > まず，高橋さん，小野さんはそのシミュレーションの目的
> > をどう置かれますか？
>
> 僕としては、E-Cellの延長を考えているので、
> 細胞の代謝および遺伝子発現等のダイナミクスを十分な精度で
> シミュレートでき、かつ得られる情報のresolutionが
> 分子生物学者に十分であることを考えています。
> 分子生物学者がどのような実験を期待するかによるのですが。
> 具体的には物質の濃度勾配の推移が分かり、それが実際とそう変わら
> なければいいかとおもっています。
分子生物学者は，そのモデルをどう使うでしょうか？
（経験的にいうとですが，あまり使うとは思えません．）
むしろ，
１．モデルは，実験ができないか，非常に難しい部分を担当する
方が良いのではないでしょうか？
実験結果を総合して作るモデルの場合，個々のサブシステム
は新しいものを産むことはありません．
だとすれば，サブシステム間の相互作用とか，組織化の過程
とか，その辺に etwas neues を探す方が良いと思います．
それと，実験では，局所のエントロピー生成とか計測するのは
不可能ですが，E-cellなら，その値が直接見れます．こうした
ことが新しいと感じます．
飯田＠ＮＥＣ
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"Life and Evolution '97"
Kazuhiro Iida,
Fundamental Research Laboratories, NEC Corporation,
34 Miyuki-ga-Oka, Tsukuba, Ibaraki, 305 Japan.
TEL +81(298)50-1142, FAX +81(298)56-6136.
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