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生命の起源 #360 : LIFE Mailinglist Archive for the Origins of Life study
LIFE Mailinglist Archive for the Origins of Life Study

ID
360
DATE
11/14/1997 12:02:35 AM
TITLE
[life:000360] Re: E-Cell
AUTHOR
"Naoaki Ono" <nono@***.***>
BODY


小野です。

ちょっと続きます。

我々が何かを部分系と見なす、つまり、
大きなシステムの中のある状態の領域、のはずのものが、
周りと別のルールでうごく部分系、と見なされたり、そうで
なかったりするような、そんな現象の代表として、
仮想的「細胞」を描いて見ようとしています。


いま試みているのは、
1、Fontana のAlChemy やEigen のHyperCycle のような、
仮想的な代謝モデルで自己触媒反応のネットワークを作る。
(物質十数?数十種、数百から数千個)

2、それに空間(先ず1D、とりあえず2D)を導入する。
(格子上をランダムウォークして、近隣のSite上の物質とのみ
反応する。格子は数十×数十ぐらい)

3、物質間に相互作用を導入して、集合、反発させる。
特に異方的な相互作用によって膜状の集合を作れる物質を
含むようにする。

4、膜を作る代謝系(局所的に集まった酵素のセット)が
生き残ったり、分裂したりする...?


2までは誰でもやっていそうですし、拡散反応系や
Turing Pattern 以上のものは出ないでしょう。
3も誰かしらやっていそうですが。
私はまだ試行錯誤中です。



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