生命の起源フォーラム (ORIGINS OF LIFE FORUM) - help
生命の起源フォーラム (ORIGINS OF LIFE FORUM)
Welcome to 生命の起源フォーラム (ORIGINS OF LIFE FORUM) - help -
生命の起源 #1730 : LIFE Mailinglist Archive for the Origins of Life study
LIFE Mailinglist Archive for the Origins of Life Study

ID
1730
DATE
05/22/2006 07:50:51 PM
TITLE
[life:001730] Re: 化学構造データベース
AUTHOR
"Origin" <origin@***.***>
BODY


二村様 LIFEの皆様

早速見てきました.
全体像をつかむ入門書として,とても良くできた本です.
現在使われている分子コードの内容やデータベースで
できることが一目でわかります.
検索アルゴリズムについては記述が少ない
ので参考文献の専門書からあたることになります.

それから,たまたま近くに,
CASオンライン活用法(Hedda Schulz & Ursula Georgy
時実象一訳 日外アソシエーツ)という本があったので
手にしたら,ケミカルアブストラクトでオンライン構造検索
が可能だと知りました.
エディタで部分構造の絵を描いて,:) それを送信すると一致
する分子の構造と,関連情報が送られてくるようです.
(えらく古くからあって,恥ずかしく思ったりして)

飯田一浩


> -----Original Message-----
> From: Origin [mailto:origin@***.***]
> Sent: Monday, May 22, 2006 1:53 PM
> To: life@***.***
> Subject: [life:001729] Re: 化学構造データベース
>
>
> 二村様
> 情報ありがとうございます.
> おひさしぶりです.ご紹介いただいた図書,筑波大学にありました.:)
> 夕方まで開いているので早速見てきます. :)
>
> 飯田一浩
>
>
>
> > -----Original Message-----
> > From: FUTAMURA Yasuhiro [mailto:futamura@***.***]
> > Sent: Monday, May 22, 2006 12:16 PM
> > To: life@***.***
> > Subject: [life:001727] Re: 化学構造データベース
> >
> >
> > 飯田様 LIFEの皆様
> >
> > 国立国際医療センターの二村(ふたむら)です。
> >
> > 飯田様がお尋ねの「化学構造検索のアルゴリズム」の件、
> > 以下の本が参考になるかもしれません。
> >
> > J. Gasteiger & T. Engel編、船津公人監訳
> > ケモインフォマティクス 予測と設計のための化学情報
> > 丸善-Willey(2005)
> > ISBN 4-621-07552-7
> > 18,000円+税
> >
> > 特に、
> > 第2章 化合物の表現
> > 2.3 線形表記
> > 2.4 組成のコード化
> > 2.5 構造情報の処理
> > 第6章 化学構造検索
> > 6.2 完全構造検索
> > 6.3 部分構造検索
> > 6.4 類似検索
> > 辺りが参考になるのでは、と思います。
> > 章末の参考文献も充実しています。
> >
> > 国立国際医療センター研究所/国立感染症研究所
> > 二村泰弘
> > futamura@***.***
> >
> > Origin wrote:
> > > LIFEの皆様
> > >
> > > 質問とお願いです.化学系,情処系の方よろしくお願いいたします.
> > >
> > > 1.化学構造の検索
> > >
> > > 化学物質の構造を比較したり,部分構造で検索できる
> > > データベースソフトが多数あるそうですね.
> > > 使ってる方,おられませんか?どんなふうに使うのでしょうか?
> > >
> > >
> > > 2.構造検索するフリーソフト,あるいはアルゴリズム
> > >
> > > 上記のデータベースは,化学物質の構造をグラフで記述しており,
> > > 部分グラフの一致,不一致で検索しているらしいのですが,
> > > 具体的アルゴリズムについて情報を持っておられる方,おられませんか?
> > > ご指導の程よろしくお願いいたします.
> > >
> > > 飯田一浩
> >
> >
> >
>
>
>

-----
Go to page top