LIFE Mailinglist Archive for the Origins of Life Study

ID
1129
DATE
02/15/2000 02:28:04 PM
TITLE
[life:01129] Re: catalytic efficicency of peptidase
AUTHOR
"Kazuhiro Iida" <iidakek@***.***>
BODY


荒様

昨日光澤さんと電話で話しました。彼は自己触媒系の
コンピュータシミュレーションをやっているそうです。
さる厳格な方に,シミュレーションで使った活性の値が
実際の酵素と比較してどう評価されるのか示しなさいと
言われているそうです。

私の意見としては,現存する酵素(ペプチターゼ)の活性と
は極めて高いので,彼が問題にしている起原での活性とを
比べることは,到底できないと思います。
またシミュレーションの種類にもよりますが,彼の場合,
物理モデルというよりは,仮想的な高分子のモデルを使われて
いるので,絶対値というよりは比のほうが重要だと思います。

それで,活性の絶対値を知ることにも意味がないわけでは
ありませんが,むしろシミュレーションの意義と,シミュレーション
の中での活性の意味を,その厳格な方にもっと良く説明する方
がいいのではと思います。

極めてブロードな活性範囲について結果を示すというのでも良い
かもしれません。

飯田

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